Die Filderklinik ist als Kompetenzzentrum Minimal Invasive Chirurgie zertifiziert. Die Abteilung trägt zudem die Auszeichnung als Kompetenzzentrum für Hernienchirurgie und das Qualitätssiegel Herniamed.
Professor Dr. Marty Zdichavsky besitzt das Zertifikat für minimalinvasive Chirurgie (MIC).